生化自动分析仪根据仪器自动化程度的高低可分为全自动和半自动两种，根据仪器反应装置的结构原理可分为连续流动式、分立式、离心式和干式四类；根据选择方式又有随机任选式和固定项目式之分。随机任选式就是多通道分析仪，是目前全自动生化分析仪的主流趋势，干式分析仪也已逐渐走进临床化学实验室以至患者家庭，下面全自动生化分析仪厂家仅从流动式和分立式两大类进行介绍。
流动式自动生化分析仪又可分为空气分段系统和非分分段系统，前者是流动式分析仪中最典型的一种。
1．空气分段系统
这种分析仪的特点是通过比饲定量泵挤压弹性样品管，空气管和试剂管（通称“泵管”），将样品依次连续地吸人并沿样品管输送，另一方面由空气管吸人的气泡将由同样原理吸入并在试剂管道中连续流动的试剂分成均匀的节段，样品流和试剂流在连续向前流动的过程中相遇、混合、透吸（必要时）、保温、反应及被测定。整个分析过程是液流在管道中连续流动的过程中完成的。
2．非分段系统
非分段系统是靠试剂空白或缓冲液来间隔每个样品的反应液，这样，在管道中连续流动的液体不被分段。非分段系统可再分为流动注入系统和间隙系统。
(1)流动注入系统：该系统的组成与空气分段系统相似，但某些结构和工作原理有所不同，空气分段系统是利用气泡分段来防止管道中各反应液在流动过程中的交叉污染，而流动注入系统则是通过将样品依次注入连续流动的试剂流管道中来达到防止交叉污染的目的的。
(2)间隙系统：该系统的结构、组成和工作原理与流动注入系统相似，但其特点是每一次进样都必须在前一样品的分析过程结束后（包括管道的清洗）才能开始，而不能连续地依次进样，每次进样同有一时间间隙，故有人称为不连续流动式分析仪。
分立式自动生化分析仪是按手工操作的方式编排程序，以有节奏的机械动作代替手工，按顺序依次操作的仪器，该类仪器的样品和试剂在各自的试管（或反应杯）中进行，试管（反应杯）可兼作比色杯。该类仪器的恒温器体积较大，要容纳需保温的试管或反应盘。分立式分析仪由单通道和多通道的，有固定项目式和随机任选式，也有大、中、小型之分。
称为第三代自动生化分析仪的离心式自动生化分析仪，也应属于分立式。因为在离心式分析仪中，每个待测样品都是在离心力作用下，在各自的反应槽内与试剂混合，并完成化学反应，继而被测定的。离心式分析仪属于“同步分析”，在离心力的作用下，各待测样品几乎同时与试剂混合、反应并被测定后打出报告；而其它分析仪是“顺序分析”，即各待测样品依次与试剂混合、反应先后被测定。
袋式自动生化分析仪也应属于分立式，它是用试剂袋代替反应管和比色皿，漏定时每个待测样品在各自的试剂袋内进行反应并被检测。还有一种称为“干式自动生化分析仪”也属于分立式。它的主要特点是采用固相化学技术，即将试剂固相于胶片或滤纸小片等载体上，测定时使一定量的待测样品分布于一张试纸片上，一定时间后用反射光度计测定。
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